申由甲的含義可以從漢字的構成和象徵意義來理解：
甲：漢字「甲」中的豎朝下，表示種子在往下紮根，寓意為「領先」。這是因為任何植物都是先生根再發芽，所以「甲」字有領先或者第一名的屬性。
由：漢字「由」中的豎上面露頭，表示種子衝破土壤長出嫩芽，往上生長。這可以比喻為萬事萬物的源泉。
申：漢字「申」中的上下兩頭都露出來，像是「甲」和「由」的結合體，描繪了植物生根發芽破口而出的過程。因此，「申」本意紮根發芽，寓意著通天入地。
綜上所述，申由甲分別代表了向下紮根、向上生長和生根發芽的過程，寓意著植物的生長和事物的進展。