《真人快打11》的故事主題設定在NetherRealm工作室的原始遊戲世界的另一個維度的破碎之後，玩家將有機會與他們最喜歡的角色交戰。
故事講述自《真人快打9》的結局以來，各種種族和聯盟之間的戰爭正在加劇，其影響力遍布遺棄現實，直到一個被暫時和平協定所抑制的強大敵人即將醒來。為了阻止這個可能的災難，來自各種族的盟友們必須面對一個共同的威脅，即由Master山中養護的一個神秘存在，它可能會導致其他一切破碎維度。總的來說，《真人快打11》的劇情可以說是十分吸引玩家的。
後續會更詳細的劇情介紹，可以諮詢玩家或者查閱相關遊戲文獻。