根據提供的信息，關於《盜墓筆記》中真正的三叔的命運，存在兩種主要的敘述：
海底墓事件：
在《盜墓筆記:怒海潛沙》中，真正的三叔並未出現，而是由解連環假扮。電子版小說中，解連環假扮的三叔逃出海底墓後昏迷住院，而在紙質版小說中，解連環假扮的三叔直接在海底墓失蹤。
真正的三叔藏起來，與解連環共用吳三省的身份。解連環假扮吳三省以吸引注意力，而真正的三叔則在暗處支持。
三叔的最終命運：
有說法指出，真正的三叔在崑崙山尋找贊生經時屍化變成了禁婆，最終自己將自己定死在了盔甲里，被趕來的吳邪發現並火化。
另一種說法是，三叔在海底古墓里失蹤，但具體命運未明，可能逃出去做了別的事情，或者真的永遠留在了海底。
綜合分析：
電子版小說和紙質版小說在描述三叔的命運時存在差異，這可能是原著與改編作品之間的不一致之處。電子版小說中，三叔最終昏迷住院，而紙質版小說中則直接失蹤。
關於三叔的最終命運，雖然有具體的描述（如變成禁婆後自焚），但這種說法似乎與其他情節有所衝突，因為如果三叔真的變成了禁婆並被火化，那麼他在後續的故事中就不可能再以任何形式出現。這可能是一個情節上的疏漏或者是對原著的不同解讀。
綜上所述，關於《盜墓筆記》中真正的三叔的命運，存在不同的敘述和解釋。電子版小說和紙質版小說的差異、以及三叔最終命運的描述，都表明了這一角色故事的複雜性和多解性。