《神印王座》的結局是一個複雜而深刻的情節，涉及多個角色的命運和轉變，主要可以分為以下幾點：
皓月的命運：
皓月，作為9頭奇美拉的毀滅之神，在魔龍皇自殺後，其第九頭——毀滅之頭重新長出，成為幾乎無敵的存在。但最終，皓月的其他8個頭咬下了毀滅之頭，從而消失。
在皓月的世界中，龍皓晨成為了他們的神，並在那個世界尋找轉生的皓月。
月魔神阿加雷斯的命運：
月魔神阿加雷斯是唯一倖存的魔神。他不是純正的魔族，是人類女子和魔族男子所生的人魔混血兒。由於這個原因，他在魔族中被視為另類，並在魔族七十二魔神柱被毀、魔族失去力量之源後仍然存活。
他建立了組織，準備推翻魔族，並與人類共存。最終，魔族人消失，但月魔神和他的女兒以及手下過上了更好的生活。
魔神皇的遺願：
魔神皇在臨終前留下了三個遺願，希望人類不要遷怒於失去魔力的魔族人，希望月魔神繼續領導魔族並約束魔族人，以及希望他的女兒能夠完成他的遺願。
龍皓晨的命運：
龍皓晨被賦予了靈魂並繼承了魔族之主的位置，決心為了人類繼續戰鬥下去。
一年後，龍皓晨與采兒等人喜結連理，並在聖殿聯邦中聲威大增，被公認為人類有史以來的第一英雄。他提出聯邦主席輪換制，並計劃在九年後徹底自由，帶著采兒遨遊天下。
綜上所述，《神印王座》的結局不僅關注於個人的命運和轉變，還涉及種族之間的衝突與和解，以及對於和平與正義的追求。