紅曲米的製作過程主要包括以下幾個步驟：
培養紅麴黴菌。首先需要準備適合菌種生長的培養基，並將菌種接種到培養基上，待菌落生長良好後，重複接種到新的培養基上，以獲得優質的紅麴黴菌菌落。
配製孢子懸液。將菌落放入容器中，加入適量無菌水，使孢子混入水中，然後搖勻溶液，製成孢子懸液。
處理原材料。選用優質大米，去除雜質，提高純度，在室溫下用冷水浸泡大米一天，使米粒充分吸水，然後反覆蒸煮。
混合發酵。將配製好的孢子懸液與大米充分混合，進行發酵培養，時間約20天，期間需保證足夠的光照和適量的空氣接觸。
風乾。大米發酵完成後，取出風乾，在陽光下曬幾個小時，但注意避免暴曬。
以上步驟完成後，紅曲米即製作完成，需要注意的是，整個過程需要保持清潔和無菌狀態，以避免污染。