留種絲瓜時，應選擇健康、成熟、無病蟲害的植株，特別是那些具有本品種特性的植株，如節間短、節間均勻、葉片大小適中、葉柄短、結瓜早、絲瓜條上下粗細均勻的植株。以下是留種絲瓜的步驟：
選種。選擇外觀完整、無病蟲害的絲瓜作爲種子來源，確保絲瓜成熟，即果皮變硬和顏色變黃。
留種。選擇根瓜或中部節位的瓜條，因爲這些部位的絲瓜結果早，生長時間長，種子飽滿，後代結瓜也早。
人工授粉。在雌花開放時，用自花的雄蕊對花進行人工授粉，授粉後套上小紙袋，防止雜交，並在花冠萎縮後去掉套袋。
採收。在植株自然枯死後採收瓜剖種，瓜種採收後應曬乾保存。
儲存。將曬乾的種子存放在乾燥陰涼的地方，最好放在密封的袋子或容器中，並在儲存前標記上品種和收穫日期。
此外，留種絲瓜田應有適當的隔離區，以防止雜交。