網路分析法是一種綜合性的分析工具，它涵蓋了圖論分析、最最佳化分析和動力學分析。這種方法主要用於檢測、分析和診斷網路中傳輸的數據，幫助用戶排除網路事故、規避安全風險、提高網路性能，並增大網路的可用性價值。網路分析通過連線法尋找變數之間的聯繫，並利用網路圖或連線模型展示數據的內部結構，從而簡化複雜系統並提取有用信息。它是一種定量分析方式，被廣泛套用於數學、社會科學、計算機科學和環境微生物學等多個領域。網路分析的主要目的是探索一個或多個系統中的實體之間的相互作用。
在微生物研究領域，網路分析是一種主流方法，它整合了多種類型的信息，可以代表系統水平的行為。通過網路分析，研究人員能夠分析物種間的共現模式，並結合物種群落數據與環境因子數據集來分析環境因子與生境物種的相互作用關係。這種方法可以幫助預測樞紐物種、優勢物種、稀有物種和其他物種之間的聯繫與相互作用，進而輔助鑑定微生物的演替狀態和生態位。網路分析能夠探究微生物類群之間和物種與環境因子之間潛在的相互作用機理，有助於確定未培養微生物所占據的功能角色或環境生態位。