根據提供的信息，美杜莎和蕭薰兒的實力對比隨著故事的發展經歷了變化。以下是詳細分析：
初期實力對比：
蕭薰兒在故事初期以斗師級別的實力出現，雖然擁有古族少主的身份和隱藏手段，但與美杜莎女王的斗宗級別實力相比，差距較大。
美杜莎女王作為蛇人族族長，擁有更高的斗皇級別實力，並且在吞噬青年帝心火後晉級為斗宗強者，與蕭薰兒的斗王實力相比，顯示出明顯的優勢。
中期實力對比：
隨著故事發展，蕭薰兒再次出現時，她的實力已經達到了斗宗級別，與美杜莎女王相當。蕭薰兒擁有異火榜排名第四的金帝焚天炎，這使得她在某些方面可能比美杜莎女王的七彩通天馬更強。
後期實力對比：
經過一系列的奇遇和成長，美杜莎女王進化為九彩吞天蟒並最終晉級為斗帝強者。蕭薰兒也經歷了覺醒和成長，最終同樣晉級為斗帝強者。在這個階段，兩人的實力達到了相當的水平，都是斗帝級別的強者。
天賦對比：
雖然蕭薰兒擁有金帝焚天炎和斗帝血等優勢，但從長遠成就來看，她的天賦並不如美杜莎女王。美杜莎女王在成長過程中更多地依靠自己的力量和智慧。
綜合評價：
根據故事的發展，美杜莎和蕭薰兒的實力在後期達到了相當的水平，都是斗帝級別的強者。兩人的成長和成就展示了不同的特點和路徑，但最終在實力上達到了平衡。
綜上所述，美杜莎和蕭薰兒在故事的不同階段展現了不同的實力水平。雖然初期美杜莎女王的實力遠超蕭薰兒，但隨著時間的推移，兩人的實力都得到了顯著的提升，最終達到了相當的水平。