舟山市民卡具有多種功能，主要包括：
政府公共服務。可用於辦理養老、醫療、失業、工傷、生育保險等社會保障業務；作為市民電子病歷及健康檔案的身份憑證；以及作為低保戶、社會救助對象等特殊人群在入學、就醫、就業、公用事務等領域享受優惠政策的憑證。
公用事業服務。支持公交、出租、輪渡、停車等小額支付功能；實現水、電、煤氣、有線電視、通訊等繳費功能；並提供部分景點年卡、門票等電子憑證功能。
商業便民服務。具有小額電子錢包功能，可在部分商場、賓館、酒店、加油站等場所消費支付。
旅遊服務。如普陀山入山年卡、朱家尖景區年卡功能，支持在舟山市藝術劇院與普陀區保利大劇院刷卡購票。
圖書館服務。支持圖書借閱功能，可在舟山市圖書館及部分區縣圖書館借閱圖書。
學校體育設施對外開放。允許使用校內對外開放的體育設施進行健身。
銀行卡借記卡功能。可辦理工行借記卡激活手續，具有異地存取、轉賬匯款、投資理財等功能。
此外，舟山市民卡還支持全國城市一卡通互聯互通，可在已加入該平台的城市刷卡乘坐公共運輸，並享受當地刷卡優惠政策。