菩提珠主要是由以下材料製成的：
菩提子：這是最常見的材質，來源於橄欖科植物的果實。成熟後的菩提子呈深褐色，表面有不規則紋理，質地堅硬。經過打磨拋光後，菩提子會呈現出油潤的光澤，手感極佳。在佛教中，菩提子象徵著覺悟和智慧。
菩提根：指菩提樹的根部，質地比菩提子更為堅硬，顏色也更深。經過打磨拋光後，菩提根呈現出獨特的黑色光澤，象徵著堅定的信念和毅力。
菩提果：指菩提樹的果實，外形與橄欖相似，但果實較小，質地較軟。顏色較淺，呈現出淡黃色或淡綠色。在佛教中，菩提果象徵著生命的延續和繁衍。
除了上述天然材料外，還有一些特殊的菩提手串，如椰殼菩提手串和紫檀菩提手串，分別以色澤深邃和深沉的色調及細膩的質地為特點。此外，還有木質材質的菩提珠，實際上是植物的果實或種子，種類達200多種，如星月菩提、金剛菩提、鳳眼菩提等。
綜上所述，菩提珠的製作材料多樣，包括天然植物果實、種子以及根部，以及一些特殊的木質材料。這些材料經過精心挑選、打磨和穿串，成為了一串串美麗的念珠，不僅具有美觀的外觀，還蘊含著深厚的文化和宗教意義。