《塞爾達傳說：織夢島》的結局主要有兩種形式：
普通結局。在普通結局中，玩家正常遊玩遊戲，擊敗最終的boss後，遊戲會播放劇情動畫。這個結局是遊戲的標準流程，讓玩家體驗到遊戲的主要故事線。
完美結局。完美結局要求玩家在整個遊戲過程中沒有任何死亡記錄。在這樣的情況下，擊敗最終boss後，遊戲會播放一段特別的劇情動畫。這段動畫暗示馬琳變成了海鷗，這是普通結局中未包含的內容。
此外，遊戲還包含了一些深邃的寓意和象徵性的元素，例如大鯨魚創造的夢境世界和林克的角色探索，以及夢魘與現實之間的界限模糊等。這些元素共同構成了遊戲的豐富內涵和引人入勝的故事體驗。