電影《特種部隊:蛇眼起源》講述了亨利·戈爾丁飾演的角色，一名背負複雜過去的獨行者，代號蛇眼。劇情如下：
蛇眼在一次偶然中救下了嵐影一族的準接班人，因此被邀請加入他們在日本的組織。
在組織中，嵐影一族不僅教會了蛇眼如何成為一名忍者，還給了他一個渴望已久的家。
隨著蛇眼過去的秘密逐漸被揭開，他的信譽和對組織的忠誠將受到考驗，甚至可能失去最親近之人的信任。
電影中還包含了《特種部隊》原著中的經典角色，如安德魯·寇吉飾演的白幽靈、烏蘇拉·科爾維羅飾演的男爵夫人、薩瑪拉·維文飾演的斯嘉麗、安部春香飾演的亞紀子、平岳大飾演的健太以及伊科·烏艾斯飾演的哈德大師等。
本片旨在全面挖掘蛇眼的神秘背景。