蜂巢蜜的食用方法有多種，可以根據個人喜好和需求選擇：
直接嚼食。開蓋後，用蜜勺挖取放入口中嚼食，每次1-2勺。蜂巢蜜兼有蜜蜂、蜂巢的功效，建議咀嚼吃，不建議沖水，因為蜂蠟會結在杯子邊緣影響飲用。嚼硬蜂蠟後可以吐出來，香甜的蜜汁咽下，咀嚼5分鐘後，剩餘的巢渣吐出來。
泡水喝。可以將蜂巢蜜直接放進溫度為四十度左右的溫開水中，攪拌到蜂巢蜜完全化開之後就可以直接飲用了。杯內壁或者表層的一些殘留物是蜂蠟，可以放心飲用。
加白醋食用。將整個蜂巢蜜浸泡在白醋中，每天取食一點，或將蜂巢中的蜜汁和白醋以一比一的比例調勻飲用。
無論哪種食用方式，都應根據個人口味和習慣來調整。