近交係數是指個體由於近交而造成異質基因減少時，同質基因或純合子所佔的百分比。它通常用來表示個體基因純化程度的百分數，反映了近交後代從近交雙親中獲得的某個基因來自雙親的共同祖先，且該基因在近交後代中純合的概率。近交係數的計算可以通過考慮近交後代從近交雙親中獲得的基因在後代中純合的概率來實現。例如，對於播報編輯羣體中個體的平均近交係數爲f時，羣體中雜合體的頻率要比按溫伯-哈代定律預期的f的比率低。以人爲例，表兄弟姐妹結婚的近交係數爲1/16，半表兄弟姐妹結婚的爲1/32，從表兄弟姐妹結婚的爲1/64。等位基因a的頻率爲p，等位基因A的頻率爲q時，子代基因型AA的頻率爲(1-f)*q^2+q*f，基因型aa的頻率爲(1-f)*p^2+p*f，基因型Aa的頻率爲(1-f)*2*p*q。
近交係數的計算還可以利用近交係數的一般公式，考慮通徑鏈和共同祖先的概念。例如，對於連續三代全同胞交配產生的後代，可以通過尋找共同祖先和通徑鏈來計算近交係數。
近交係數的變化範圍在0-1之間，通常用來描述雙親親緣關係的遠近。當與配雙方所生後代的近交係數大於0.78%時，與配雙方屬於近交。