阿拉瓜利河涌潮的原因主要包括以下幾點：
天文大潮：當太陽、地球和月球的中心在一直線上時，引力疊加，形成天文大潮。
河口形狀：阿拉瓜利河河口呈喇叭形，外寬內窄。潮水湧入時，由寬變窄，潮位被推高。
風的影響：河口受信風的影響，順潮流方向推高潮位。
河流徑流量大：阿拉瓜利河位於熱帶雨林氣候區，全年降水較多，河流徑流量大且穩定。入海口附近河水較淺，漲潮時海水與河水相互頂托，水流漫溢。
地勢低窪平坦：阿拉瓜利河流經地區地勢低窪平坦，排水不暢，有利於潮水的上涌。
河床較淺：下游流速緩慢，河流以堆積作用為主。涌潮逆流而上，帶來的泥沙淤積，使河床較淺。
綜上所述，阿拉瓜利河涌潮的原因是多因素共同作用的結果，包括天文大潮、河口形狀、風的影響、河流徑流量大、地勢低窪平坦以及河床較淺等因素。