使用魚缸虹吸管的步驟如下：
準備虹吸管和水桶。需要一箇水族箱虹吸管和一箇水桶來盛裝髒水。如果虹吸管的軟管足夠長，可以到達下水道或後院爲植物澆水，則水桶不是必需的。
準備魚缸。在清理過程中無需將魚移出魚缸，但應移走所有裝飾品，因爲廢物會聚集在它們下面。有些人會選擇清潔藻類和過濾器，以便所有多餘顆粒被虹吸管清除。
啓動虹吸管。將虹吸管的換水器放入魚缸內，出水口放入桶內，打開水制閥門，並輕輕擠壓氣腔以啓動出水。降低進水口以吸取沙中的魚糞和飼料殘渣。注意出水口應低於進水口。
撤下虹吸管。當準備停止虹吸時，用手遮住虹吸管開口並提起，同時向上翻轉管子，讓剩餘的水排入水桶。之後，用與原魚缸水溫度相近的新水重新填滿魚缸，並添加脫氯劑去除水中的氯、氯胺和其他有毒化學物質。
應注意，虹吸管主要由進入水族箱的塑料管和進入水桶的長而柔軟的軟管組成。在使用軟管時需注意，它容易壓扁，可能影響水流速度。此外，虹吸作用原理是水往低處流，當水位平衡後，虹吸就會停止。