鸚鵡魚是卵生類魚類，它們通過體外受精和體外發育的方式繁殖。
在繁殖期，雄魚會先排出精子，然後雌魚會在精子的中央排出卵子，這樣魚卵就會變成受精卵。這種受精方式只能使一部分卵受精，而受精的卵中只有很少一部分能夠成功孵化成小魚。由於雄性鸚鵡魚通常不具備繁殖能力，因此需要選擇其他品種的雄魚來與雌鸚鵡魚雜交，以確保受精卵能夠成功孵化。
此外，鸚鵡魚在繁殖期間會變得比較暴躁，可能會攻擊其他魚或躲避其他魚，以保護產卵區域。在產卵前，雌魚腹部會明顯變大，生殖部位也會變得突出。產卵後，飼養者需要將親魚撈出，以避免它們喫掉魚卵，並保持水溫在28至30攝氏度之間，以促進受精卵的孵化。