鹿茸的保存方法取決於其狀態，即鮮鹿茸或乾鹿茸，保存方法會有所不同。
對於鮮鹿茸的保存，主要方法有：
冷凍保存。將鹿茸用細紗布包裹，放入可以密封的塑膠袋中，儘量排出空氣後密封，放入冰櫃冷凍室保存。確保溫度保持在零攝氏度以下，避免鹿茸化凍。
烘乾保存。將鮮鹿茸快速烘乾並放在通風處，加入一些花椒粒防止生蟲，確保鹿茸不受潮，可以保存三至五年。
對於乾鹿茸的保存，主要方法有：
密封乾燥保存。將乾鹿茸放入密封袋或使用防潮紙包裹，然後埋在米中或放在石灰缸中以吸收潮氣。
花椒保存法。將乾鹿茸用細布包好，放入樟木箱或皮箱內，上面撒上花椒後再密封，可以有效防蟲。
無論哪種保存方法，關鍵在於確保鹿茸的乾燥、無霉爛和無蟲蛀。正確的保存方法可以使鹿茸保持一到兩年甚至更長時間不變質。