黑色沙漠手遊的遊戲世界是由一個宏大的故事構建的，講述了一個由數百個不同事件交織而成的大冒險故事，旨在吸引並保留一個又一個充滿好奇心和探索欲望的玩家。故事主要由“教團”中的精英角色講述，例如總指揮貝爾特倫、女性NPC莎琳娜等等，每個人都有自己獨特的故事，可以在完成特定任務後逐步揭曉。
遊戲中主線任務主要以五個板塊為分割：起始點沙漠邊陲的邊境村莊；女神雕像遺址下沉廣場中的貝爾圖塞墓地；裝備打造以及新手武器和技能的地方馬莫里公國；女神雕像之下的莫古力王國；以及最後一塊位於大陸最南端的神秘海域。
玩家在遊戲過程中可以與NPC對話了解故事背景，通過完成任務來推動劇情發展，解鎖新的地圖區域。同時，遊戲還設有多個隱藏任務和彩蛋，等待玩家自行發掘。
總的來說，黑色沙漠手遊的故事系統非常豐富，提供了許多有趣的角色和任務，為玩家提供了一個充滿挑戰和驚喜的遊戲世界。玩家可以通過完成任務、探索地圖和發掘隱藏內容來逐步揭開遊戲世界的神秘面紗。