《刺客信條：Unity》的故事發生在18世紀中葉的歐洲，講述了刺客兄弟會和聖殿騎士之間的鬥爭。
遊戲的主角是一位名叫艾雷亞的刺客，他生活在一個充滿神秘和危險的世界。艾雷亞的過去被神秘的面紗所掩蓋，他被捲入了兩個強大勢力之間的衝突。他與其他刺客兄弟一起，為了保護自由和真理而奮鬥。
故事中，艾雷亞與一位名叫莉婭的聖殿騎士有了深厚的感情，但他們的愛情受到了來自兩個敵對勢力威脅。在經歷了一系列冒險和挑戰後，艾雷亞和莉婭最終走到了一起，但他們無法改變兩個組織之間的衝突。
《刺客信條：Unity》的故事結束於一種痛苦的抉擇，一種來自兩個世界不可避免的悲劇。艾雷亞最後在遊戲中殺死了他的兄弟和師傅以獲取力量，擊敗了聖殿騎士，但也因此喪失了自己的生命和兄弟間的信任。
總的來說，《刺客信條：Unity》的故事是一個關於愛情、背叛、冒險和犧牲的故事。這個故事展現了刺客和聖殿騎士之間的鬥爭，同時也展現了主角艾雷亞的個人成長和犧牲。