CRE菌，全稱為耐碳青黴烯類抗菌藥物的腸桿菌科細菌，是一種對碳青黴烯類抗生素具有強大耐藥性的細菌。CRE菌屬於抗碳青黴烯腸桿菌科（Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae），這類細菌通常存在於人體腸道內，但不會在腸道內引起感染。CRE菌的傳播主要通過糞便，而在醫療機構中更為常見。
CRE菌感染通常發生在醫院或養老院等醫療機構，特別是在ICU、腸胃科、外科等病區，由於患者抵抗力較弱或使用了多種抗生素，CRE菌得以生長繁殖，從而引發感染。CRE菌感染可引起呼吸道感染、泌尿系統感染、血液感染等多種病症，嚴重的情況下可能導致敗血症、休克等併發症。對於CRE菌感染，目前的治療方法有限，通常採用聯合用藥的方法，使用兩種或以上的抗生素進行治療，並且要根據藥敏試驗結果來確定具體的抗生素種類和劑量。
為了預防CRE菌感染，醫療機構應加強感染控制措施，如嚴格執行手衛生和環境衛生管理，避免濫用抗生素，並加強對CRE菌的監測和控制。對於已經感染CRE菌的患者，應採取針對性的抗生素治療，並加強隔離措施以防止其進一步傳播。