EM菌可以通過以下方法製作：
準備材料。需要準備一個乾淨的空瓶子、淘米水、過期牛奶、紅糖。其中，淘米水和牛奶的比例為1:1，紅糖的量是淘米水和牛奶總量的一半。
混合材料。將淘米水和牛奶混合，加入紅糖，然後密封瓶子並搖晃均勻。
發酵。將瓶子放在高溫、避光、無陽光直射的地方發酵，時間為半個月。
過濾。發酵後，瓶子內會出現分層，需要使用細過濾網過濾出底部的澄清液體，這就是EM菌。
使用方法。將EM菌兌水一百倍後使用，可以用於澆灌或噴施植物，有助於預防病害、促進根系發育和改善土壤質量。
此外，還可以將乾酵母粉和紅糖加入溫水中攪拌後，靜置2小時，然後倒入淘米水中，放在室內溫暖避光的角落發酵。夏天需要發酵一周，冬季約需半個月。製作好的液體不再產生氣泡，並出現白色沉積物，即為成功。過濾掉雜質後，得到的液體即為EM菌原液，可以保存一年左右。使用時，將原液兌水50到一百倍，可以用於噴灑植物或養花、澆菜等。