要生成GCT文件，可以按照以下步驟進行：
準備數據：首先，需要一箇常見的表達矩陣，其中行可以是基因名、蛋白質名、序列號等，列是樣本名。
添加版本號和維度信息：在矩陣前面加上兩行，第一行是GCT版本號（例如`#1.3`或`#1.2`），第二行是關於表達矩陣的維度信息，即總共有幾行幾列。
可選的metadata：如果表格中加入了metadata，還需要加上備註列和行的數目。
保存爲TXT文件：使用Excel處理得到這樣的文件後，另存爲製表符分隔的txt文件。
修改文件擴展名：將txt文件的後綴改爲gct。
驗證文件合規性：如果不確定自己生成的GCT文件是否合規，可以使用R語言和cmapR包來驗證。首先安裝並載入cmapR包：
安裝BiocManager包（如果尚未安裝）：`install.packages("BiocManager")`
使用BiocManager安裝cmapR包：`BiocManager::install("cmapR")`
載入cmapR包：`library(cmapR)`
通過以上步驟，就可以生成一箇符合規範的GCT文件了。