《Nature》的投稿流程大致如下：
提交稿件。作者需要登錄《Nature》的官方網站並註冊一個賬號，然後，按照網站上的指示完成投稿過程，這包括選擇文章類型、輸入論文標題、添加/編輯/刪除作者信息、提交摘要、輸入關鍵字、選擇分類等。
編輯初審。提交稿件後，編輯會進行初步審查，以決定是否將稿件送交同行評審，如果編輯決定送審，通常不會傳送郵件通知，但在投稿網站上可能會看到一個zip壓縮檔案，表明稿件已送審。
同行評審。送審後，稿件將由審稿人進行評審，審稿人完成評審後，編輯會根據評審意見決定稿件的命運，可能是直接拒絕、接受需大修、接受需小修或傳送給其他期刊。
修改與覆審。如果稿件需要大修或小修，編輯會要求作者在一定時間內（通常大修6個月內，小修3個月內）完成修改，修改完成後，稿件會被送回審稿人進行覆審。
最終決定。在所有評審環節完成後，編輯會做出最終決定，如果稿件被接受，將進入出版流程。
出版流程。稿件在原則上接收後，作者可能需要按照《Nature》的要求進行一些格式或小錯誤的修正，正式接收後，通訊作者需要填寫開源許可證並支付文章處理費，最後，《Nature》的出版團隊會進行排版和校稿，然後線上發表。
此外，作者可以通過「Research Square」網站賬號查看審稿人的審稿進度和詳細時間等信息。