RDS檔案格式是用於以R本機格式存儲R對象的檔案格式。它比Rdata格式更緊湊，讀取速度更快，並且能夠存儲任何類型的R數據結構。RDS檔案包含在數據中編碼的R特定信息，如屬性、變數類型等。RDS檔案使用`saveRDS`和`readRDS`函式進行讀寫操作，而Rdata檔案使用`save`和`load`函式。RDS檔案格式與Rdata格式的一個主要區別在於，RDS只能處理單個R對象，而Rdata可以保存多個對象。儘管如此，RDS在處理單個對象時提供了更大的靈活性，因為還原對象的名稱不必與存儲時的名稱相同。
使用`.rds`檔案保存數據集的示例代碼如下：
```R
saveRDS(object=iris, file="my_data_frame.rds")
```
要將數據載入回R中，可以使用以下代碼：
```R
iris2 <- readRDS(file="my_data_frame.rds")
```
RDS檔案在保存時會先進行壓縮，因此占用的記憶體空間較小。但是，由於壓縮過程的存在，保存速度可能相對較慢。需要注意的是，`.rds`和`.rda`（即.Rdata的簡稱）格式與其他統計系統或軟體不兼容，因此無法以這種格式向未使用R的人傳送數據。此外，從R的一個版本升級到另一個版本（儘管1.4版本之後保持了兼容性）可能會導致不兼容性。
總結來說，RDS檔案格式是一種用於存儲單個R對象的二進制格式，它提供了高效的數據存儲和讀取方式，但與多對象存儲方法相比，它只能處理單個對象。此外，由於它的二進制特性，它與其他軟體不兼容，且在不同版本的R之間可能會存在兼容性問題。