《三國志12》修改器的使用方法主要包括以下幾種：
激活無限金錢或無限糧食。通過數字鍵1或2，或使用F1鍵進入武將資料界面時，可以讓所屬勢力獲得無限的金錢或糧食。
增加或減少兵力。使用數字鍵3或4，或在戰鬥中指向一箇城市時，可以增加或減少5萬兵力。
激活無限祕策點數。使用數字鍵+，進入或離開一箇城市後，該城市所屬勢力會獲得無限的祕策點數。
武將屬性全滿、滿忠誠度或特性全開。使用F1、F2或F3鍵，進入武將資料界面時應用。
戰鬥修改。包括無限戰鬥時間、軍隊無敵、無限技能發動點數等。使用數字鍵5至F5、數字鍵6至F6、數字鍵7至F7等。
此外，修改遊戲數據時，可以打開San12Editor.exe，點擊左上角的文件，打開存檔或劇本，然後編輯勢力、軍團等選項進行修改。修改器還允許修改數據類型，如都市、武將、君主、勢力、外交、寶物等，並保存修改。修改遊戲戰鬥時間和鎖定、城門防禦等設置，可以影響遊戲玩法。