內部結構可以從不同的角度和領域來理解：
在組織管理的語境中，內部結構指的是組織各要素的排列組合方式，它涉及組織各部門、各層次之間人與人、人與事的相互關係。這種結構是組織根據其目標和規章而採用的各種組織管理形式的統稱，通常包括縱向層次結構、橫向部門結構和整體組織體制。縱向層次結構體現了管理層次和管理幅度，橫向部門結構通常按管理過程中的功能分爲決策機構、執行機構、參謀機構及監督機構，而組織體制則是這些關係制度化的表現形式。
在生物學或人體結構的語境中，內部結構指的是生物體各組成部分的排列和組合方式。例如，人體的內部結構包括細胞、器官、組織如皮膚、骨骼、肌肉、血液等。人體的細胞數量極其龐大，組織包括肌肉組織、結締組織、神經組織、上皮組織等。人體的骨骼有206塊骨頭組成，血液佔體重的8%。
在藝術和文學的語境中，內部結構是指構成藝術形象的各種藝術元素之間的內在聯繫和組織形態，特別是人物之間及人物、事件、環境之間的相互關係和構造形態。
在物理學或物質系統的語境中，內部結構表現爲物質系統內部各要素之間在數量上保持一定的比例關係，在性質上相互協調、相互適應，在形態上呈網絡狀。這是物質的一種穩定結構，體現了物質系統本身具有的相對獨立性。