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什麼是分子對接

計算生物學方法

分子對接是一種計算生物學方法,主要用於研究分子之間的相互作用,尤其是在藥物設計和生物學研究中得到廣泛套用。

分子對接的目標是預測兩個分子(通常是藥物分子和生物大分子如蛋白質)之間的最佳相互作用方式,這個過程涉及將一個小分子(配體)放置在另一個大分子(受體)的活性位點處,並通過模擬最佳化配體的位置、構象和與受體的結合模式,以找到能量最低、最穩定的構象。分子對接包括剛體對接、半柔性對接和柔性對接,這些方法在對接過程中允許研究體系的構象變化程度不同。

分子對接不僅涉及空間匹配,還包括能量匹配,確保複合物的整體結合自由能最低。在藥物設計中,分子對接有助於發現新藥物,最佳化現有藥物,以及對疾病的治療和預防提供理論支持。