專款專用原則是現代會計制度中的一條重要原則，其核心內涵是：對指定用途的資金，應當嚴格按照規定的用途使用，並且需要單獨覈算和反映。這一原則不僅適用於事業單位會計，也是事業單位會計準則的一部分，確保資金按照取得時的不同用途進行使用，並設立專戶進行管理。
在事業單位會計中，出資者通常不要求資金取得資本收益或資本回收，但必須按照預定的用途使用。這意味着專用基金、投資基金等都必須按照規定的用途使用，不得移作他用，特別是不得用於生產經營和對外投資。此外，事業單位還需定期向財政部門或主管部門報告專項資金的使用情況，並在項目完成後提交支出決算和使用效果的書面報告，以便接受檢查和驗收。
例如，黨費作爲專項資金，也必須遵循專款專用的原則。在使用過程中，需要明確指定用途，單獨覈算，並及時向撥款部門報告資金的使用情況和進度。