職能部門是指在一箇組織中負責特定管理職能的部門，這些部門通常負責計劃、組織、指揮等工作。
職能部門可以根據其權力和組織結構分爲兩種類型，一種是職能制（多線制），這種部門的職能部門有直接向下級單位下達工作任務或工作指令的權力，如政府的組成部門；另一種是直線職能制，這種部門的職能部門不能直接向下級單位發佈行政命令，需要經過共同主管的同意，通常只有建議權、指導權和協調權，大多數企業的職能部門都屬於這種類型。常見的職能部門包括財務部、人力資源部、市場營銷部、技術部、品質部等。這些部門在企業或組織內負責管理、規劃、監督等工作，是組織運作的關鍵部分。