過濾滅菌是一種通過使用含有微小孔徑的濾菌器，利用物理阻留的方法除去液體或空氣中的微生物，以達到無菌或滅菌目的的技術。
這種方法主要用於不耐熱的生物製品，如血清、毒素、抗生素等，以及空氣的除菌。常用的濾菌器包括薄膜濾菌器（孔徑爲0.45μm和0.22μm）、陶瓷濾菌器、石棉濾菌器（即Seitz濾菌器）、燒結玻璃濾菌器等。特別地，使用孔徑不超過1nm的過濾器可以確保得到無菌濾液，非常適合用於對熱不穩定的物質。
過濾滅菌的原理基於細菌或病毒等微生物無法通過具有緻密孔隙的濾材，從而被阻擋在濾材上，達到除菌或滅菌的效果。這種方法在製藥、食品、生物工程等領域有廣泛應用。