何姓的起源有多箇說法，主要包括：
源自姬姓。最初周武王的夫人是姜太公的女兒，曾夢到天帝對她說，你將會生下一個兒子，叫做虞，可以將唐國給他。等到孩子生下來的時候確實在手中寫有一箇虞字，所以人稱叔虞，而叔虞的後裔中出了一箇叫做韓王安的人，當時唐國被秦國所滅，於是後裔就流散到了各地，最終在江浙定居，而由於“韓”“何”同音，於是後裔都轉爲了何姓。
源自漢朝的官吏名。也有部分何姓是根據漢朝的官吏名改姓而來的，這一官吏名是專屬於女官的，叫做“娙何”，於漢武帝時期劉徹所設置，等到了後來漢元帝時，這一官職便成爲了妃嬪的名號，居於昭儀之下，地位還是非常高的。所以有部分以祖母的官職爲姓的就演化出了何姓氏族。
源自冒姓改名。明朝時期著名的方孝孺被施以極刑之後，方氏家族的人爲了避難，於是就將姓改爲了何，不過比較特殊的是，何氏家譜中提到，這支何系族人在生前可姓何，但是死後就複姓方了。其次就是漢朝也有一位叫做何苗的人將原姓朱做了更改。
源自歸姓。相傳黃帝時代已有何姓，何人是東夷族歸夷的一支，以荷爲圖騰，並在黃河下游的山東菏澤建立了何國，其中何侯的一支可能隨虞舜帝南巡於九嶷山，而留居於今湖南的寧遠、道縣一帶，至今何姓仍爲道縣的大姓。
源自外族的改姓。外族血液流入何姓主要發生在兩晉以後。
綜上所述，何姓的起源是多源的，包括源自姬姓、漢朝的官吏名、冒姓改名、歸姓以及外族的改姓等。