余 雲岫是中 國近代 醫 學史上具有重要影 響的人物，他的主要著作 包括：
《 靈素商 兌》。 該 書是一部 對中 醫 經典著作《 內 經》 進行批判和否定的作品， 於1916年刊印，在 現代中 國 醫 學史上被 視 為 「 廢止中 醫 」主 張的先 聲。
《 醫 學革命 論》。余 雲岫撰 寫了多版本的《 醫 學革命 論》， 包括第一、二、三集，集中 體 現了他在 醫 學 領域的革新理念。
《古代疾病名候疏 義》。 這本 書是 對中 醫古籍的 詳 細梳理，反映了余 雲岫在中 醫研究方面的深入。
《余氏 醫述》。余 雲岫身 後留下《余氏 醫述》 這部作品。
此外，他 還 編 寫了多 種 醫 學科普 書籍，如《 內科全 書》、《外科 療法》、《 飲食防毒法》等。