保密室的作用主要包括以下幾個方面：
作為機關、單位重要保密基礎設施。它是開展保密管理的重要物質條件，對於維護國家秘密安全至關重要。
保證涉密載體絕對安全。設定獨立封閉的場所是保密管理的最基礎要求。
存放涉密信息、檔案。保密室是處理和存放涉密信息、檔案的必備場所。
具備物理防護和技防設施。如門、牆、窗的物理防護，監控系統、紅外報警系統、電子門禁系統等技防設施。
有人防措施。如值班人員，以及涉密計算機、紅黑電源、視頻干擾器、涉密印表機、密碼檔案櫃等保密設備。
以上各點共同確保了保密室在保護國家秘密和促進機關、單位工作中的核心作用。