《假面騎士555》的故事圍繞著三位年輕騎士的冒險和成長展開。他們不僅要面對各種邪惡的假面騎士和外星人，還要面對社會壓力、同伴誤解和矛盾等內心的挑戰。
三位主人公分別是乾巧、草加雅人飾演的園田真理以及小田切讓飾演的“爆裂”變身的假面騎士Faiz。他們因不同的原因而結識了真理，並被她召喚而來，成為對抗邪惡勢力的假面騎士。
在故事中，他們遇到了神秘的科學家木場勇治（渡部秀飾），他既是真理的叔叔，也是推動故事發展的重要角色。他不僅提供了關鍵的科技支持，還作為故事中的“智囊”為三位主人公提供了許多策略和指導。
此外，故事中還穿插了各種有趣的角色和情節，如神秘的“Faiz世界”、與邪惡假面騎士的戰鬥、真理的身世之謎等等。這些元素不僅為故事增添了懸念和趣味性，也使得三位主人公在冒險中不斷成長和突破自己。