南京大屠殺的原因是多方面的，主要包括以下幾點：
日本軍國主義的惡性膨脹。日本自19世紀60年代明治維新以來走上軍國主義道路，至第二次世界大戰期間達到頂峰。日本軍國主義對中國的侵略從局部戰爭升級為全面戰爭，南京大屠殺是這一背景下的極端表現。
日軍軍紀敗壞和指揮官的個人行為。如松井石根和朝香宮鳩彥王等日軍指揮官的行為對南京大屠殺的發生起到了推波助瀾的作用。
日軍對中國的殘酷統治。日本占領上海後，由於後勤補給不足和指揮失誤，加上對戰爭的激勵和獎賞制度，導致日軍在南京及周邊地區的燒殺搶掠和強姦等暴行。
日本對軍人的培養。日本培養軍人成為殺戮機器，對戰爭行為進行激勵和獎賞，加劇了南京大屠殺的嚴重性。
日軍對南京文化、教育的破壞。日軍不僅在身體上摧殘中國人民，還試圖在文化、教育上對南京乃至整箇中國進行侵略和破壞。
綜上所述，南京大屠殺是日本軍國主義侵略行為的一個極端體現，涉及軍事、政治、文化等多個層面。