司馬遷的死亡原因並沒有在歷史記錄中明確記載，因此他的死亡原因存在多種推測和假設，主要包括被處以宮刑後自然死亡、被漢武帝殺害、自殺以及壽終正寢等。以下是詳細介紹：
被處以宮刑後自然死亡。司馬遷因替李陵辯解觸怒漢武帝，獲罪入獄，處以宮刑，這可能是他選擇的一種代替死刑的方式。
被漢武帝殺害。有推測認爲司馬遷因《史記》一書觸怒漢武帝，有被殺的可能性。
自殺。另一種觀點是基於司馬遷在完成《史記》後的心境，以及他在《報任安書》中表達的思想，推測他可能選擇自殺。
壽終正寢。也有觀點認爲司馬遷可能自然死亡，即壽終正寢。