基底核主要包括以下三部分：
尾狀核：形如彎曲的尾巴，卷伏在背側丘腦背外側，全長伴隨側腦室，分頭、體、尾3部分。頭突向側腦前角，體繞背側丘腦背外側弓形向後，變細的尾行經側腦室頂，並在下角末端連杏仁體。
豆狀核：位於背側丘腦外側，島葉深部。水平切面和額狀切面上均呈尖向內側的楔形，並被白質板分為外部的殼和內部的蒼白球，蒼白球又被白質板分為內側部和外側部。蒼白球是紋狀體中較古老的部分，又稱舊紋狀體，殼和尾狀核進化上較新，合稱新紋狀體。
杏仁體：位於海馬旁回鈎的深面，側腦室下角的前端，與尾狀核尾相連屬於邊緣系統的一部分。
以上三部分共同構成了基底核，它們在大腦中發揮著重要的功能，包括控制自主運動、參與情感、記憶、獎勵、學習等高級認知功能。