學校制度是指為了指導和約束學校的行為以及與學校相關的組織、機構、人員等的行為而制定的教育法律、規章等成文的規則體系，同時包括學校、學校所在的社區中組織、人員認可的與學校相關的習慣、道德標準、風俗等未成文的規則體系。
學校制度具體包括以下幾個方面：
各級各類學校的性質、任務、入學條件、修業年限及彼此之間的關係。
教育法律、規章等成文的規則體系，以及與學校相關的習慣、道德標準、風俗等未成文的規則體系。
學校的教學安全工作管理，包括安全教育、事故報告制度、與公安派出所的密切聯繫、教師師德教育等。
學校法人制度和新型的政校關係，以及學校依法民主、自主的管理模式。
學校制度是教育制度的一個重要組成部分，服從並受制於國家的巨觀教育制度。