富士康被查的原因主要有兩個方面：
稅務問題：隨著稅務部門對企業的監管力度不斷加強，不少企業都因稅務問題而遭受調查和處罰。近期稅務部門對富士康的稅務稽查引發了廣泛關注。據報導，稅務部門主要針對富士康在廣東、江蘇等地的重點企業進行了專項檢查。其中，廣東省深圳市龍華區稅務局對富士康科技集團深圳龍華園區進行了現場核查。此外，江蘇省崑山市稅務局也對富士康科技集團崑山園區進行了現場核查。
企業用地問題：隨著國家對土地資源的管控越來越嚴格，企業用地成為了稀缺資源。在此背景下，不少企業為了獲取土地使用權而採取各種手段。據報導，自然資源部門主要針對富士康在河南、湖北等地的重點企業進行了現場調查。其中，河南省鄭州市自然資源局對富士康科技集團鄭州園區進行了現場調查。此外，湖北省武漢市自然資源局也對富士康科技集團武漢園區進行了現場調查。
以上兩點是富士康被查的主要原因，但具體原因還需要根據實際情況和相關部門的調查結果來確定。