小丑和哈莉·奎因分手的原因是多方面的，具體如下：
哈莉·奎因對小丑的愛是深情的，而小丑對待哈莉·奎因的方式則是充滿虐待，他把她當作取樂的工具和發泄瘋狂的工具，這種不平等和虐待關係是導致分手的一箇重要原因。
隨着哈莉·奎因加入其他組織（如自殺小隊）並逐漸感到獨立，她對小丑的依賴性減少，這也是分手的一箇原因。
哈莉·奎因想要殺蝙蝠俠的事情加劇了兩人的矛盾，小丑試圖阻止她，但最終哈莉·奎因意識到小丑並不真正愛她，而是將她作爲工具。
在電影《猛禽小隊和哈莉·奎茵》中，哈莉·奎因的獨立感進一步增強，她決定不再依賴小丑，這也是分手的直接原因之一。
綜上所述，小丑和哈莉·奎因的分手是由於雙方情感的破裂、哈莉·奎因獨立性的增強以及彼此之間不健康的依賴關係所導致的。