小眼子菜是一種多年生水生草本植物，屬於眼子菜科眼子菜屬。它的根莖發達，白色，多分枝，常於頂端形成紡錘狀休眠芽體，並在節處生有稍密的鬚根。莖圓柱形，通常不分枝。葉子分為浮水和沉水兩種類型，浮水葉革質，披針形、寬披針形至卵狀披針形，沉水葉披針形至狹披針形，草質，具柄。花序穗狀，頂生，具花多輪，花小，被片4，綠色。果實寬倒卵形，花期在5月至10月之間。小眼子菜原產於東亞，廣泛分布於中國的南北各省區，以及俄羅斯、朝鮮和日本。它們生長在池塘、水田和水溝等靜水中，水質通常呈微酸性至中性。
小眼子菜在傳統醫學中被用於清熱解毒、利水通淋等功效，可用於治療急性結膜炎、黃疸、水腫、白帶異常、小兒疳積、蛔蟲病等病症。外用時，可用於治療癰癤腫毒。扁莖眼子菜和小眼子菜的其他種類如絲葉眼子菜和光葉眼子菜也有各自的形態特徵和分布地區。
需要注意的是，「小眼睛」在另一個上下文中指的是梅童魚，這是一種東台近海特產的魚類，以其肉質鮮美滑嫩而聞名。這與小眼子菜是兩個完全不同的概念。