少年派的沉船原因是由於主角的父親在給動物餵食鎮靜劑時，不小心也將鎮靜劑餵給了船上的豬和牛。由於父親對動物園的活不熟悉，可能餵錯了藥物。船上的人食用了這些肉後，在暴風雨來臨的夜晚都昏睡過去，導致整艘船無人操作，在遭遇暴風雨時不幸沉船。主角一家人和佛教徒由於不吃肉，在暴風雨中保持了清醒，從而有機會逃生。主角在發現事態嚴重後，叫醒了家人並與其他倖存者一起逃到了救生艇上。最終，主角為了不讓保險公司進一步調查沉船的真實原因，避免暴露家人之間的悲劇，編造了兩個故事，一個是沒有廚子的故事，另一個是關於哥哥逃生失敗的故事。