選擇山葵醬時，應注意以下幾點：
類型。純山葵醬只使用山葵和鹽發酵製作，味道辛辣，適合用於生魚片、壽司等日式料理；混合型山葵醬在純山葵醬的基礎上添加其他配料，如大豆、芥末等，口味更豐富，適合搭配烤肉、火鍋等食物；調和型山葵醬將多種調味料與山葵混合製作，口感更柔和，適合用於炒菜、拌麵等中式菜餚。
新鮮度。新鮮山葵的肉質莖應勻稱肥厚，呈圓柱狀，葉柄為新綠色。避免購買肉質莖有劃傷或已大範圍變黑變軟的山葵，這種品相的山葵風味不佳。
擦磨方式。擦磨得越細膩的山葵醬味道越嗆鼻。黑芥子酶（myrosinase）在擦磨過程中被釋放，這個過程最好加水，以促進異硫氰酸丙烯酯等物質的生成。新鮮山葵從擦磨到食用的最佳時間大約為15分鐘，超過這個時間，風味會下降。