巫姓的起源有多種說法，主要包括以下幾個方面：
源於上古時期。古人相信萬物有靈，並通過舞蹈等儀式召喚神靈，這種職業的人被稱為「巫」。這些巫師的後代中，有人以「巫」作為姓氏。
黃帝時代的巫彭。被認為是巫姓的始祖之一，他是一位醫生，以醫術精湛而聞名。
商代大臣巫鹹。他是用筮占卜的創始者，同時也是一位著名的占星家，他的後代中有人以「巫」為姓。
源於官職名。如商朝時期的巫祝官職，負責占卜，這些官員的後代也以「巫」為姓。
源於蒙古族。後漢化改姓為巫。
此外，還有說法提到魯國的公巫召伯，他的子孫後代稱為「公巫氏」，後來簡化為巫姓或召姓。總的來說，巫姓的起源是多源的，涵蓋了從上古時期到特定歷史人物的多個方面。