微生境是指在大生態環境中更小、更特定的生物棲息地。
微生境的概念在生態學中非常重要，因為它涉及到生物與其周圍環境的相互作用。例如，一個荒漠中的綠地，雖然荒漠是一個大的生物群系，但綠地對於某些生物來說是一個更適合生存的微生境。微生境可以是由於環境因素（如溫度、濕度、光照等）的細微變化而產生的小範圍環境差異。這些差異對生活在其中的生物有直接的影響，如影響生物的生長、繁殖和分布。
在更廣泛的生態系統中，微生境可以是森林中的一塊空地或城市中的一個花園。在人體細胞層面，微環境則指的是細胞間質及其體液成分，這對細胞的正常功能至關重要。