微生物包埋法是一種用於固定微生物細胞的方法，它通過將微生物細胞截留在水不溶性凝膠聚合物孔隙的網路空間中，從而實現細胞的固定化。這種方法的主要原理包括聚合作用、沉澱作用或改變溶劑、溫度、pH值等條件，使細胞被固定在凝膠聚合物中。
包埋法操作簡單，對細胞活性影響較小，能夠製作出高強度的固定化細胞球。這種方法廣泛套用於微生物、動物和植物細胞的固定化，其中凝膠包埋法是套用最廣泛的細胞固定化方法。固定化細胞可以用於提高酶或微生物的穩定性、重複使用性，以及在水處理、生物修復等領域中的套用。
此外，包埋法使用的載體材料可以是天然高分子材料（如海藻酸鈉）或合成高分子材料（如聚乙烯醇、聚丙烯醯胺），這些材料需要具備一定的機械強度和抗衝擊負荷，以防止微生物脫落。