微生物的拮抗作用是指微生物通過產生某些代謝產物或改變環境條件來抑制其他微生物的生長繁殖，甚至殺死它們。這種作用在自然界和日常生活中非常常見，主要通過以下幾種機制實現：
改變微環境。某些微生物，如乳酸桿菌，在生長過程中產生乳酸，降低環境的pH值，從而抑制其他微生物的生長。
占位保護。微生物與人體黏膜上皮細胞緊密結合，形成生物屏障，排斥外來微生物。
營養爭奪。一些有益菌，如厭氧菌，因其數量龐大，在與外來微生物競爭營養方面占據優勢，限制其生長。
分泌抗菌物質。微生物產生的抗生素和細菌素等抗菌物質對其他微生物具有強大的抑制和殺傷力。
免疫作用。正常微生物群與宿主免疫力協同作用，有效發揮生物拮抗效果。
產生抗生素或分泌胞外水解酶。拮抗菌通過產生如毒素、抗生素等代謝產物來抑制病原菌的生長。
空間和營養的競爭作用。拮抗菌與病原菌競爭空間和營養資源，影響病原菌的生長。
影響寄主抗性。通過提高寄主的抗病性來抑制病原菌。
這些機制共同構成了微生物之間複雜的相互作用網路，對於維持生態平衡和人類健康具有重要意義。