微觀結構是一箇多領域應用的概念，具體含義根據不同的學科領域有所不同，詳細介紹如下：
在化學、生物學和物理學領域。微觀結構指的是物質、生物、細胞在顯微鏡下的結構，以及分子、原子甚至亞原子的結構。這些結構通常非常微小，需要藉助電子顯微鏡等高科技工具進行觀察和理解。例如，在材料科學中，微觀結構涉及到材料內部各相組份的類型、數量、尺寸、形狀和分佈。
在金融學領域。微觀結構特指證券交易價格形成與發現的過程與運作機制，涉及市場開收盤制度、訂單形式、價格監控機制等信息披露機制。
在社會科學領域。微觀結構可以指代一羣人、他們之間的關係以及他們對彼此行動的可能回應。這種結構通過互動產生，並通過重複的互動逐漸穩固下來，將個體互動與更廣泛的宏觀結構相連。