"心中小九九"主要有兩層含義：
"心中小九九"是指人們心中的小想法、小計劃、小心思，通常是私密的、不願意讓別人知道的。這些想法可能是一些秘密、夢想、欲望或計劃，往往是人們不願意公開或分享的。每個人都有自己的心裡小九九，這些小九九可能是對某個人的暗戀，或者是對某個事情的期待和希望。在日常生活中，有時候我們會在心裡暗自想著一些事情，這些想法可能是我們內心深處的真實想法，也可能只是一時的衝動和幻想。無論是什麼樣的心裡小九九，它們都是我們內心深處的一部分，是我們自己的秘密花園，需要我們自己去探索和體驗。
"心中小九九"也可以指那些有心計、會算計、善謀劃的人，比喻為自己的打算，猶言小算盤。